Для начала установим python-software-properties:

apt-get install make python-software-properties

Добавляем репозиторий содержащий php 5.5:

add-apt-repository ppa:ondrej/php5

Обновляем дистрибутив:

apt-get update

Устанавливаем PHP последней версии(5.5.x):

apt-get install php5 libapache2-mod-php5

Здесь может появиться сообщение о необходимости обновить apache. Обновляем, последовательно выполнив

apt-get install -f
dpkg --purge --force-depends "apache*"
apt-get install -f

Еще раз

apt-get install php5 libapache2-mod-php5

и (если на сервере установлена панель ISPManager) обновляем кеш установленного ПО и перезапускаем сам ISPmanager:

/usr/local/ispmgr/sbin/pkgctl cache
killall ispmgr