Чтобы включить в VestaCP подпись писем при помощи DKIM для домена — подключитесь к серверу по ssh  и выполните в терминале: 

v-list-mail-domain-dkim <username> <domain>

где, 
<username> — имя пользователя у которого добавлен домен в панели Vesta (можно глянуть в самой панели)
<domain> — имя домена для которого требуется включить ДКИМ. 

После этого панель сама сделает все необходимое и отдаст публичный ключ, который нужно прописать в адресных записях домена в виде записи типа TXT 

mail._domainkey   TXT   v=DKIM1; k=rsa; p=Copy-And-Paste-The-DKIM-Public-Key-Here

где, 
Copy-And-Paste-The-DKIM-Public-Key-Here — этот самый ключ который отдала предыдущая команда

Возможные ошибки:

 Выполнение v-list-mail-domain-dkim вернуло ошибку "command not found".
Чтобы исправить — просто укажите полный путь к v-list-mail-domain-dkim

/usr/local/vesta/bin/v-list-mail-domain-dkim <username> <domain>